，对后世的影响最大最深，因此，被后世尊称为“外科学的鼻祖、药物麻醉术的先驱、中国运动医学和康复医学的首创者”。
麻沸散是华佗在精研前代医学典籍的基础上，总结前人用于战争、暗杀或其他活动中运用“迷药”的经验，配合人在醉酒时所表现出的沉睡状态后，反复实验、长期摸索而发明出的一种酒服麻醉剂。华佗的麻沸散是世界上最早的麻醉药，也是外科医学上一项划时代的贡献。华佗采用麻沸散，将病人进行全身麻醉后，先后成功实施了开切肠、剖腹取胎、切除大肿瘤等大型手术，大大提高了外科手术的适用范围和疗效，并且，使中国使用麻醉剂的历史比西方提前了将近1600多年。麻沸散的处方未能流传于世，但它对麻醉学的发展，作出了极为重大的贡献。后世医家在华佗麻沸散的影响和启迪下，结合临床经验，创造出不少新的麻醉药剂，减轻了病人的痛苦，推动了中国麻醉学的向前发展。华佗的麻醉术还曾流传到朝鲜、日本、摩洛哥等地。公元九世纪，阿拉伯医学进入全盛时期，其中的外科手术，正是因为引用了华佗的麻醉术而得到发展。
华佗重视养生导引之术，在总结前人经验的基础上，创编出了一套医疗体操——五禽戏，从而开创运动医学的先河，被人们誉为“中国运动医学和康复医学的首创者”。五禽戏以模仿虎、鹿、熊、猿、鸟五种动物的动作，每一禽戏都针对身体的某一部位而设计，如虎练骨、鹿练筋、熊练脾胃、猿练心、鸟练肺。 现代医学研究证明，作为一种医疗体操，五禽戏不仅使人体的肌肉和关节得以舒展，而且有益于提高肺与心脏功能，改善心肌供氧量，提高心肌排血力，促进组织器官的正常发育，达到畅通经络、调和气血、活动筋骨、滑利关节的作用。五禽戏自问世以来，在民间长盛不衰，直至今日仍是很多人强身健体的首选项目。经过上千年的发展，现在的五禽戏衍生出二十余种不同的流派，各具风格但殊途同归。
天人相应
华佗重视“天人相应”的观点，主张人体虽受自然界变化规律的影响，但机体亦有适应自然界四时变化规律、完成自身生命活动的过程。只要掌握并适应了这条规律，就能达到健康长寿的目的。如不能适应自然界变化而出现的病变，华佗认为还是从“天人相应”的观点出发，积极探求病源，采取适应自然界变化的措施，从整体出发，秉着“虚则补之，实则泻之”的原则，从本求治，才能达到“形体有可救之病，天地有可去之灾”的目的。
运养结合
华佗对“防重于治”“无病先防”“既病防变”的预防为主的思想尤为重视，他提倡养生导引，以增强人的体质；同时，华佗意识到运动对人的健康和疾病康复的重要性，从而提出“譬如户枢，终不朽也”的着名论断，从而指出“人体欲得劳动，但不当使极耳。动摇则谷气得消，血脉流通，病不得生”。
轶事典故
漆叶青黏散
樊阿追随华佗学医，向华佗讨教可以服用而且对人体有好处的药方，华佗给了他一方漆叶青黏散。漆叶末一升，青黏末十四两，坚持服用可以去掉三种体内寄生虫，对五脏有利，使身体轻健，头发乌黑。樊阿听从华佗的话，活了百余岁。
试医丢命
华佗行医时经过一个布店，布店的学徒想考验一下华佗。正好学徒刚吃过饭，见华佗走近，他一个翻身，跳进柜台，两手捂着肚子，摇头打滚地哀号起来，布店老板忙请华佗进店为他诊治。华佗看了看学徒的气色，又切了切脉，完了后，脸色一沉，痛惜地对老板说：“无救了，准备后事吧！”老板明知学徒是在装病，他又故意追问道：“华先生，你看这小子还有多少阳寿？”“捱不过今夜子时！”说罢， 华佗叹息着离去。他刚一转身，布店老板就在背后冷笑道：“哼，都说他是神医，我看只是徒有虚名！”然后他转过身，对学徒说道：“好了，别装了，快起来吧，人都走远了！”可不管他怎么叫唤，那学徒依旧一个劲地在地上翻来覆去地号叫，还有豆大的汗珠从额头上冒出来。原来他刚才假装疼痛、翻腾打滚时用力太猛，挣断了肠子，难怪华佗说无救了。
刮骨疗伤
关羽在攻打樊城时，用言语挑衅曹仁，曹仁大怒，令部下齐发毒箭。曹兵万箭齐发，一支毒箭正好射中早关羽的右臂。神医华佗被请来为关羽治伤。华佗在查看过关羽的伤势后，认为要想痊愈、不留后患，必然划开皮肤，用刀刮去附着在骨头上的毒素。华佗提出，先在一清静处立一木头，上面钉一只大环，让关羽将伤臂穿于环中，并用绳索紧紧系住，再取厚被蒙住将关羽的头脸，然后才动手疗毒。关羽听后，不以为然，认为此种痛法不足为惧。他让关平备下酒，叫马良陪他对弈，一边喝酒下棋，一边让华佗实施手术。关羽的右臂鲜血淋漓，脸上虚汗淋漓，手中的棋子掉了下去，但仍咬牙不出声，只将掉落的棋子拾起，继续下棋。华佗刮骨，关羽喝酒，